Nå er praksisoppholdet mitt ferdig, og jeg gleder meg til å dele det siste med dere!

Her samler jeg dagens prøve parasitter for eksperimentelle opptak.

Først vil jeg gi en liten oppsummering av laboratoriearbeidet vi har gjort i løpet av perioden. Vi har gjennomført eksperimentelle opptak av parasitter som ble utsatt for ulike legemidler. Disse opptakene brukte vi til å trene opp programmet DeepLabCut, slik at det kunne spesialisere seg i å spore bevegelsene til parasittene. Deretter prosesserte vi alle opptakene, og fikk resultater som vi kunne lage grafer av og analysere videre.

Underveis gjennomførte vi også eksperimenter med proteinase K-behandling og in situ hybridisering. Siden forrige blogg valgte vi å gjenta in situ-eksperimentet, fordi vi i første runde ikke fikk noen tydelig signal i parasittene. Dette tydet på at kjemikaliet kanskje ikke påvirket halen, men det kunne også skyldes tekniske feil eller lav sensitivitet. Tidligere transkriptomikkdata indikerte nemlig at genene burde være uttrykt der. Derfor bestemte vi oss for å teste flere genprober og også kombinere to gener fra forrige eksperiment.

På denne disse to parasittene fikk vi veldig bra signaler for en acetylkolin-gated klorid kanaler (genkode: ACC-1.2).

Denne gangen fikk vi bedre resultater, blant annet fordi vi fikk gode tips fra kollegaene våre om hvordan vi kunne ta bedre bilder. Vi identifiserte også flere feilkilder fra det første forsøket, og klarte å unngå de fleste av dem i andre runde.

Vi avsluttet praksisoppholdet med en presentasjon av prosjektet vårt på et labmøte. Vi fikk mange gode tilbakemeldinger og tips til hvordan vi kunne tolke resultatene våre videre. Til slutt ryddet vi labben og sa et siste farvel til sneglene!

Dette praksisoppholdet har vært utroliglærerikt. Jeg kunne ikke sett for meg dette semesteret uten dette emnet, det har overgått alle forventningene mine. Vi fikk stor frihet til å velge hva vi ville jobbe med, og vi fikk jobbe mye mer selvstendig enn jeg hadde trodd på forhånd. Jeg har blitt bedre til å tenke kritisk, og til å løse problemer som oppstår underveis i laboratoriearbeid.

Jeg er veldig takknemlig for at jeg fikk ha praksis hos Chatzigeorgiou-gruppen på Michael Sars. Det har vært en spennende og lærerik opplevelse som jeg definitivt kommer til å ta med meg videre.

Bilde av nesten hele lab-gruppen. Marios, gruppe lederen, var utreist og kunne dessverre ikke være med.

Og ikke minst, tusen takk for at dere har fulgt med på bloggen min. Kanskje vi ses igjen en dag!